Fairy Tail Blue Mistral forteller historien om hvordan himmeldragedreperen Wendy Marvell møtte Carla, sin venn for livet, og eventyrene de hadde sammen før han begynte i Fairy Tail guild. Wendy Marvell ble oppdratt av dragen Grandeeny til å utøve den vindbaserte himmeleldragedrepermagien. Hennes eneste venn er Carla, en magisk katt forvist fra sitt hjem. Når Grandeeny plutselig forsvinner må Wendy og Carla møte farene i Dragon Valley alene.
